डॉ. नितिन गंगाने पहले महाराष्ट्र के सेवाग्राम स्थित महात्मा गांधी इंस्टीट्यूट ऑफ़ मेडिकल साइंसेज (MGIMS) के डीन और बेलगावी स्थित KLE एकेडमी ऑफ़ हायर एजुकेशन एंड रिसर्च के वाइस चांसलर रह चुके हैं। उन्हें UICC की ओर से 'यामागिवा-योशिदा मेमोरियल इंटरनेशनल कैंसर स्टडी ग्रांट' मिला है, जिसके तहत उन्होंने फ्रांस के ल्योन में कैंसर पर रिसर्च करने वाली इंटरनेशनल एजेंसी (WHO) और अमेरिका के बेथेस्डा में NIDCR/NIH में काम किया है। उन्हें 'एसोसिएशन ऑफ़ नॉर्डिक कैंसर सोसाइटीज़' और 'इंडियन काउंसिल ऑफ़ मेडिकल रिसर्च' से फेलोशिप भी मिली है। उनके नाम 180 से ज़्यादा नेशनल और इंटरनेशनल पब्लिकेशन दर्ज हैं। वे सात रिसर्च प्रोजेक्ट्स में प्रिंसिपल इन्वेस्टिगेटर और 12 प्रोजेक्ट्स में को-इन्वेस्टिगेटर रहे हैं। इन प्रोजेक्ट्स को IARC (WHO), UICC, NIH, यूनिवर्सिटी ऑफ़ उमेआ जैसी इंटरनेशनल संस्थाओं और ICMR, UGC, DST जैसी नेशनल फंडिंग एजेंसियों से फंड मिला था।
वे इंडियन काउंसिल ऑफ़ मेडिकल रिसर्च की गवर्निंग बॉडी के सदस्य थे। वे महाराष्ट्र यूनिवर्सिटी ऑफ़ हेल्थ साइंसेज़ की मैनेजमेंट और एकेडमिक काउंसिल के सदस्य भी थे। इससे पहले उन्होंने महाराष्ट्र यूनिवर्सिटी ऑफ़ हेल्थ साइंसेज़, नासिक, महाराष्ट्र की सीनेट में भी काम किया था। वे 2006 से 2009 तक इंडियन एसोसिएशन ऑफ़ पैथोलॉजिस्ट्स एंड माइक्रोबायोलॉजिस्ट्स के महाराष्ट्र चैप्टर के प्रेसिडेंट रहे।